昌吉汽车站隶属于新疆昌运汽车运输有限责任公司，位于昌吉市乌伊西路66号。下设客运西站、客运东站、和中亚中站，是昌吉回族自治州唯一一家“二级”、“四星级”汽车客运站。

目前，客运班线通达昌吉回族自治州内各县（市）、农牧团场及石河子、乌苏、塔城、克拉玛依、伊宁等地州（市）和甘肃、宁夏、四川省。日发班次1120班，日均旅客发送量2.5万人次，营业班线30条。

汽车站现有在职员工70人，其中：女员工50人，男员工20人，由汉、维吾尔、哈萨克、回、蒙古、布依、满7个民族组成，平均年龄38岁。党员12人，团员22人，大专及本科以上学历30人。

按照道路客运“三优、三化”标准，汽车站在服务配套设施上，充分体现“以人为本、科学管理”经营理念。围绕服务升级，提升形象，加快“硬、软”件设施的投入，稳步推进服务效能建设。工作中奉行“服务热情周到、管理科学规范”质量方针，大力推行“123456”工作法、“十个一点”精细化服务、无障碍换票和延时服务等一系列特色服务，精心打造“新疆昌运”客运服务品牌，并顺利通过了ISO9001质量管理认证，企业社会信誉和经济效益都位于同行业前列，为自治州“三个文明”建设做出了积极的贡献。